يمتثل مركز تطوير في عمله إلى مجلس إدارة يقدم له التوجيه والاشراف العام، ويتم انتخابه مرة كل ثلاث سنوات من قبل الجمعية العمومية، والتي تضم بدورها أعضاء منالشبكات الأهلية المظلاتية الأربع: شبكة المنظمات الأهلية الفلسطينية والهيئة الوطنية للمؤسسات الأهلية الفلسطينية، والاتحاد العام الفلسطيني للجمعيات الخيرية والاتحاد الفلسطيني العام للمنظمات غير الحكومية- غزة. ويتمتع أعضاء مجلس الإدارة والجمعية العمومية ببكفاءات وخلفيات اقتصادية وأكاديمية وخبرات في قطاع العمل الأهلي والمدني.
